تدور احداث الفيلم في البحر، بالقرب من جزيرة “هاشيجو جيما“، طوكيو. اجتمع مهندسون من جميع أنحاء العالم لتشغيل «باسيفيك بوي» على نطاق واسع، وهي منشأة بحرية لربط الكاميرات الأمنية المملوكة لقوات الشرطة في جميع أنحاء العالم. يجري هناك اختبار لبعض «التكنولوجيا الجديدة» القائمة على نظام التعرف على الوجوه. في هذه الأثناء، يزور كونان والمحقق بويز “هاشيجو جيما” بدعوة من “سونوكو” ويتلقون مكالمة هاتفية من “سوبارو أوكيا” لإبلاغهم بأن موظفًا في اليوروبول قُتل في ألمانيا على يد “جين” من المنظمة السوداء. كونان، الذي يشعر بالقلق، يتسلل إلى المنشأة ويجد أن منظمة السود اختطفت مهندسة…! علاوة على ذلك، فإن محرك أقراص يو اس بي يحتوي على معلومات معينة بحوزتها وينتهي به الأمر في أيدي المنظمة… كذالك، الظل الأسود يزحف أيضًا على “هايبارا أي“…